В статье рассматриваются современные инновационные процессы в агропромышленном комплексе России и их влиянию на обеспечение продовольственной безопасности. В работе проведен анализ динамики инновационного развития сельского хозяйства. Особое внимание в статье уделено технологическим инновациям, являющимся ключевыми для поступательного развития анализируемой сферы. Обобщение лучших практик внедрения инноваций в сфере АПК как в России, так и за рубежом позволило соотнести идентифицированные точки роста с современными инновационными продуктами и технологиями. Целью исследования явился анализ эффективности инновационного развития агропромышленного комплекса России и идентификация системных проблем, существующих в данной сфере, в том числе влияющих на вопросы обеспечения продовольственной безопасности. Отмечается, что даже в сравнении с российскими показателями по другим отраслям, сельское хозяйство имеет низкую инновационную активность. Так удельный вес организаций, осуществлявших технологические инновации, в общем числе организаций в сфере промышленного производства – 18,5%, в сфере услуг 21,4%. При этом, удельный вес инновационных товаров, работ, услуг в общем объеме отгруженных товаров, выполненных работ, услуг в промышленности составляет 6%. При достаточно скромной динамике инновационного развития сельского хозяйства, доля процессных инноваций во всей совокупности инноваций (технологических, маркетинговых и организационных) составила 72% в 2018 году. С принятием совокупности стратегических программ развития агропромышленного сектора и инноваций в России, бюджетное финансирование несколько улучшилось, однако поступательная динамика отсутствует в сельском хозяйстве с 2017 года, а в производственном секторе АПК темпы роста бюджетного финансирования составляют всего 1,1%. В качестве итога исследования отмечено влияние на уровень продовольственной безопасности нереализованность потенциала российского сельского хозяйства в силу отсутствия качественной и эффективной инновационной инфраструктуры.