На период до 2030 г. основными направлениями развития агропродовольственного комплекса России определены: повышение научно-технологического уровня, развитие новых направлений экспорта, создание единой цифровой платформы, улучшение качества жизни сельского населения. Реализация намеченных целей будет сопровождаться существенными структурными сдвигам в инновационной сфере. Цель исследования: совершенствование методических подходов к исследованию инновационных структурных изменений в агропродовольственном комплексе России; оценке потенциала его экономического роста с учетом изменений в отраслевой структуре и перехода на новые информационные, цифровые технологии. Разработаны теоретико-методологические подходы к исследованию инновационных структурных сдвигов в агропродовольственном комплексе и их воздействия на достижение экономического роста; обоснованы предложения по совершенствованию механизмов управления инновационными структурными изменениями. Исследование показало, что за последние 10 лет в производстве и переработке агропродовольственных товаров произошли инновационные преобразования, что подтвердилось ростом валовой добавленной стоимости, снижением затрат на производство, повышением производительности труда. Выявлены тенденции изменения ресурсоемкости продукции агропродовольственного комплекса России. Построена математическая модель многофакторной линейной регрессии, характеризующая влияние индикаторов инновационных структурных сдвигов на изменение объемов производства валовой продукции сельского хозяйства. Результаты расчетов по модели свидетельствуют, что большая часть прироста производительности труда в отрасли достигается за счет инвестиций и затрат на инновационную деятельность. Рассматриваемые индикаторы инновационных структурных сдвигов оказывают положительное влияние на динамику производства продукции сельского хозяйства России.